深圳政府重疾险和商业重疾险有以下几个区别：
1、深圳政府重疾险是补偿性质的，它报销的费用不可以超过被保险人产生的医疗费用，商业重疾险是给付型的，它不管被保险人用了多少医疗费用，只要被确诊为合同约定的重大疾病，就会一次性给付保额；
2、深圳政府重疾险是政府主导的，它带有一定的福利性，商业重疾险是保险公司推出的保险产品，它是以盈利为目的的；
3、深圳政府重疾险的参保条件比商业重疾险的参保条件要宽松。
目前，深圳政府重疾险和商业重疾险虽然存在以上几个区别，但它们并不存在任何冲突，所以在经济条件允许的情况下，投保人可以同时为自己购买深圳政府重疾险和商业重疾险。
