不同的甲状腺疾病病因不一样，先天性的甲状腺发育异常或者是甲状腺手术破坏，或者是自身免疫的损伤都可引起甲减。甲亢既可以是自身免疫性的弥漫性甲状腺肿，也可以是多结节性的甲状腺肿出现甲亢，高功能的甲状腺瘤也可引起甲亢。甲状腺癌是由于遗传或者环境因素共同作用，各种甲状腺疾病都可以引起甲状腺结节，甲状腺结节并不是疾病的诊断，仅仅是临床表现。另外，像地方性的甲状腺肿是由于饮食当中碘的摄入不足引起的，像各种甲状腺的炎症是由于病毒感染或者自身免疫性的原因。甲状腺疾病病因非常的复杂，需要找到病因进行相应的治疗。
