1、发行公司的区别：红筹股和H股都是和中资企业息息相关的股票，红筹股基本由内地在境外的窗口企业或在境外控股，还有收购已上市的外资企业构成；而H股，则由内地的企业构成。
2、注册地的区别：虽然红筹股和H股都在港股上市，但红筹股的注册地在境外，H股的注册地在境内。
3、监管的区别：上市红筹股在国内需要向证监会备案和出具报告，遵守香港法规，受香港证监会监察；H股公司需要同时遵守内地和香港的法律法规，受两个监管体系的监管。
4、增发新股的区别：红筹股增发新股，标准以港股规定的为依据，而H股增发新股，就要同时受到证监会、港监会、港交所多方的审批核查，且发行量有限。
5、认股权的区别：持有认股权的人有权按合约规定的价格购买上市公司股票，认股权证由公司发行，常作为一种激励手段。红筹股中认股权一般是报酬型的。H股的认股权，则基本没有，主要也是因为注册地在境内，其一是境内股东持有的内资股无法在港股上市，其二是想要增发H股需要多方核准，且增量不会太大，而对员工而言行使H股的权益涉及到境外投资，同样操作繁琐，一般直接用现金方式替代了。
主要来讲，发行红筹股有着便捷性相对较高，企业一般无需境内监管机构的审批，在境外上市后的融资活动灵活且相对自由等优点；发行H股按国内相关申报制度来的，国内企业会更熟悉，而且证监会对H股上市有政策扶持，手续相对直接，上市需要时间短。两类股票虽然有着各自不同的“出身”，但都是为了实现筹资融资，帮助企业经营发展。
