新农合作医疗只是一种医疗保障体系，属于社保保险的一种；社保除了医疗保险外，还有养老保险、失业保险、生育保险、工伤保险，所以农村合作医疗和社保范畴区别还是比较大的。
社保中的医保，可以用于药店买药、住院治疗报销等。新农合目前在多个城市只有住院才能报销，少部分城市看病就诊也可以报销。社保只要有正式的工作或在城镇都可以参加社保。而新农合，只有农村户口才可以办。
