甲状腺术后比较常见的并发症首先是术后的出血，大多发生在术后24小时内。若出血快而量多，病人会有窒息的风险。然后喉返神经损伤也是比较常见的并发症，喉返神经损伤的病人会出现明显声嘶症状。当喉上神经损伤时，会引起呛咳、吞咽障碍、说话声音比较低沉。其他的并发症还有甲状旁腺的损伤，可导致术后的低钙血症，引起肢体抽搐或麻木，甚至喉痉挛。另外，甲状腺术后容易出现甲状腺功能减退，此外，若是甲亢病人进行手术，术中可能会诱发甲亢危象等。
