甲状腺手术医疗保险报销，包括商业医疗保险和基本医保都可以报销。
1.商业医疗保险：主要是可以对被保险人因为疾病或者意外而产生的合理且必要的医疗费用进行报销。而甲状腺手术属于因为疾病而产生的，所以因此而产生的医疗费用，商业医疗保险可以在扣除已经用基本医保以及其他医疗保障报销过的医疗费用和免赔额后，按照保险合同约定对剩余的医疗费用进行报销；
2.基本医保：若参保人因为疾病或意外而产生住院医疗费用、门诊医疗费用等，基本医保都可以进行报销，因此基本医保是可以报销参保人因为甲状腺手术而产生的医疗费用的，不过各地基本医保可报销的比例有所差异，所以具体可以报销多少，还应当以当地政策规定为准，比如长沙城乡居民医保，对于参保人在乡镇卫生院、社区卫生服务机构而产生的住院医疗费用可在扣除起付线200后报销85%；在三类收费标准医疗机构产生的住院医疗费用可在扣除300起付线后报销70%；在二类收费标准医疗机构产生的住院医疗费用可在扣除500起付线后报销65%；在市级一类收费标准医疗机构产生的住院医疗费用可在扣除1100起付线后报销60%。
商业医疗保险如何报销甲状腺手术？
1.报案：发生保险事故，比如被保险人确诊甲状腺疾病且必须要手术治疗后，就需要及时通知保险公司，进行报案，一般建议在48小时内报案；
2.准备报销材料：根据保险公司要求准备报销材料，比如一般需准备好住院医疗费用发票和住院费用清单、出院记录、疾病诊断书、医保结算单、门诊病历本、身份证、银行卡、甲状腺检查报告。
3.先用医保报销：被保险人结束治疗出院时，可以先在医疗机构的结算窗口使用医保报销，然后再自行垫付医保不予报销部分的医疗费用；
4.提交报销材料：出院后，被保险人需提交报销材料给保险公司；
5.审核：保险公司审核报销材料，并确认具体的报销方案；
6.报销：审核通过，保险公司予以报销，报销金一般可打入被保险人指定的银行账户中；
7.结案：报销完毕，保险公司结案。
需要注意的是，有的商业医疗保险有垫付功能，因此被保险人在住院期间，就可以先申请保险公司垫付，等到出院后，再提交报销材料给保险公司，保险公司会将报销金直接抵扣此前已经垫付的金额。
