合作医疗是公司交还是自己交，取决于是否与公司签订劳务合同。在职期间与公司签订正规劳务合同，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记，缴纳五险一金，合作医疗包含在五险内，因此合作医疗由公司进行缴纳；如果没有签订劳务合同，隶属于劳务派遣，合作医疗需自己缴纳。
还有个人户是自己缴纳医疗保险。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。
