百万医疗险有免赔额。一般来说，百万医疗险都是有免赔额限制的，通常是一万，但是也有部分百万医疗险的免赔额是五千、一万五、两万等，具体数额还要看保险合同是如何约定的。
对于投保了百万医疗险的被保险人来说，如果要使用百万医疗险进行报销，那么还必须要先扣除了免赔额之后，才能对剩余的医疗费用进行报销，若是被保险人发生的医疗费用未超过免赔额，那么百万医疗险是不会予以报销的。比如若百万医疗险的免赔额为一万，那么若被保险人发生了五万的百万医疗险保险范围内的医疗费用，就还需要先扣除一万免赔额后，才能对剩余的四万医疗费用，按照报销比例进行报销。
需要注意的是，如果在用百万医疗险报销之前，已经先使用了其他的医疗保障报销过相关医疗费用，那么还需要先扣除已经用其他的医疗保障已经报销过的医疗费用，以及免赔额后，才能对剩余的医疗费用进行报销。
