多数新生儿甲状腺功能低下属于先天性疾病。甲状腺功能对新生儿的生长发育非常重要。甲状腺功能低下时，对新生儿的大脑发育和智力有最直接、最严重的影响，出现呆小症。因此一旦发现甲减，要积极进行治疗，使甲状腺功能维持正常，否则对智力、全身的肌肉、骨骼发育和性腺功能，都有比较大的不利影响。新生儿甲状腺功能低下，可在医生指导下进行替代药物治疗，比如左甲状腺素片，并每2-3个月复查1次。通常来说，替代治疗的左甲状腺素片没有明显副作用。
