结构性存款是受存款保险制度保护的，根据相关规定，结构性存款纳入商业银行表内核算，按照存款管理，要求银行纳入存款准备金和存款保险的范围。但与普通存款不同，普通存款是本金与利息都在存款保险制度的保障范围内，结构性存款只有本金享受保护。
而利息部分，由于与金融类产品或者非金融类产品挂钩，按照衍生产品交易管理，所以不享受存款保险制度的保护。
