农合医疗退保可以到参保地的社保中心申请退费，携带身份证件、缴费证明、社保卡到新农合社保处填写申请单表，符合退保条件的话就可以退费。
职工医疗保险和农村合作医疗不能重复参保，如果是刚参加工作，单位可以办理五险一金但要求个人退出农村合作医疗，这种情况可以找单位出具一份证书，表明你是该单位刚招聘的员工。不自行缴纳农村医疗保险费用的，默认不再参加农村合作医疗保险，不能享受医疗费用报销。参加农村合作医疗保险的人员未满退休年龄死亡的，还需要提供死亡证、火化证明材料、户口证明等材料，经社保中心审核完毕后，可以退还其个人账户资产余额。
不是所有人都可以申请农合退保的，如果不想继续缴纳费用，可以直接停缴，停缴后农合医疗也就不再有效。
