二者都属于报销型的医疗险，但存在以下几点不同：
1.保障范围不同
百万医疗险主要提供住院医疗、特殊门诊、门诊手术、住院前后门急诊等保障，此外，还会增加外购药、质子重离子、费用垫付和就医绿通等实用的增值服务。当合同范围内的医疗费经医保报销，超过一万元后，可以100%报销。
小额医疗险主要提供感冒发烧等小病小痛导致的住院和门诊医疗保障，部分产品还会增加住院津贴、意外身故/伤残、疾病身故等其他保障。
就保障范围而言，百万医疗险的报销范围更广，报销比例也更好。
2.保额不同
百万医疗险主要保障重大疾病和重大意外导致的医疗费。所以保额很高，一般在200-600万之间。
而小额医疗险的主要解决感冒发烧等小病小痛产生的医疗费，所以保额不高，住院保额一般为1-5万。
3.免赔额不同
免赔额就是保险公司报销的起付线，只有超过了免赔额才能进行报销。
百万医疗险的保额很高，保险公司为了控制理赔风险，一般会设计1万的免赔额作为理赔门槛。
小额医疗险保额低，免赔额也比较低，一般为100-300元，有的产品甚至没有免赔额。
4.续保条件不同
百万医疗险虽然大部分都是一年期的产品，但市面已经推出一些高性价比的长期医疗险了，如好医保长期医疗（6年版）复兴联合的超越保（保6年）、好医保长期医疗（20年版）平安e生保（保20年）。
小额医疗险大部分都是一年期的医疗险，而且因为理赔门槛低，保险公司每年赔付的次数和钱数比较多，产品稳定性差，如果第二年产品下架，就买不了了。部分产品如果发生过理赔，第二年也无法续保。
