在办理深圳大病医保时，有三种方式可以选择：
第一种是基本医疗保险一档参保人：个人账户余额达到上年度社平工资5%的，由市社保局协助统一从个人账户直接划扣缴费参保，参保人个人不需要办理手续。但如果不愿意参保又被自动划扣缴费的，接下来社保部门将建立相关退出机制，退回已经划扣的缴费。
第二种是对于个人账户余额不符合划扣条件的一档参保人以及二档、三档参保人：由本人通过上网自愿申请参加。
三是实体网点窗口办理。可在全市社保分局（站）37个窗口办理。此外，还开通团体办理，单位如需为员工统一办理参保，可通过相关邮件联系保险公司，将有医保服务专员协助办理。对于享受低保的非从业居民、孤儿、优抚对象及重度残疾居民，分别由市民政和残联部门统一办理缴费。
