学校保险和农合可以同时进行报销，但是不能重复报销。
学校保险通常称之为学平险是意外险的一种，而新农合是医保的一种，两者的性质是不同的，所以是可以进行同时报销的，通常是会先报销新农合，剩余的没有报销的一些费用超过学平险的免赔额的，这个时候可以用学平险在进行一个二次的报销，但是新农合报销完之后，达不到学平险的一个报销的标准了的话，也就不能够进行重复报销了。
学平险和新农合两者一个是意外险一个是医疗险，学平险是可以做新农合很好的一个医疗报销的补充的，新农合报销比例一般在40——80%之间，有自付比例、起付线和自费药不报；学平险，可以保意外身故、意外伤残、意外单独门诊、意外医疗、疾病住院医疗。
持有学校保险和新农合的报销流程：
1、选择医保定点医院，且是二级以上公立医院就诊，拨打保险公司电话报案；
2、前期个人垫付医药费，出院时在社保窗口由新农合先报销。
3、准备好出院资料：包括门诊病历本、门诊发票、疾病诊断书、出院记录、意外事故证明（意外情况需要）、医保结算单、住院费用总清单、住院发票、父母身份证、银行卡、孩子身份证。
4、联系保险业务员上门领资料或自己去保险公司网点递交资料。
5、保险公司审核，审核通过就可以转账。
学校保险报销所需详细资料：
意外单独门诊：门诊发票、门诊病历本、意外事故证明、孩子证件、父母银行卡、户口本。
意外住院报销：出院记录、疾病诊断书、医保结算单、住院费用总清单、住院发票、门诊发票、门诊病历本、意外事故证明、孩子证件、父母银行卡、户口本，严重意外事故可能需要提供CT相关检查报告。
疾病住院报销：出院记录、疾病诊断书、医保结算单、住院费用总清单、住院发票、门诊病历本、孩子证件、父母银行卡、户口本。
重大疾病理赔：癌症需要病理报告，其他重疾通常需要疾病诊断书、相关检查报告或鉴定报告。
身故理赔：需要火化证、公安机关销户证明、医学死亡证明、法定受益人户口本和银行卡。
