商业医疗保险和合作医疗不是一样的，有一定的差异：
1.商业医疗保险是由消费者自行缴纳保费，和保险公司签订保险合同后，若被保险人在保障期间因为疾病或者意外而发生合理且必要的医疗费用，则保险公司可以予以报销；合作医疗则属于社保中的医保，主要以大病统筹兼顾小病补偿；
2.商业医疗保险一般是由保险公司进行报销；合作医疗则一般需要在农村合作医疗定点办事处办理报销手续；
3.商业医疗保险一般是需要在保险合同约定的医疗机构进行治疗，才能获得报销；合作医疗则一般需要在基本医保定点医疗机构进行治疗才能获得报销；
4.商业医疗保险不报销生育相关医疗费用、牙科相关医疗费用等；合作医疗则可以按照规定对生育相关医疗费用、牙科费用等进行报销。
