南京银行是有存款保险的。南京银行成立于1996年，是一家由国有股份、中资法人股份、外资股份以及多个股份共同组成股份制商业银行，主要经营业务范围包括了吸收公众存款、发放短期、中期和长期贷款、办理国内结算、办理票据承兑与贴现、发行金融债券、从事银行卡业务、代理收款项及代理保险业务以及其他经过中国银行业监督管理委员会批准的业务，属于国家正规银行。因此，南京银行是有存款保险的，而在南京银行的线下网点以及官网中，也可以看到其有存款保险进行保障的标志。
一般来说，凡是在我国境内设立的、通过中国银监会审批设立的银行业金融机构，都有存款保险。
